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El lupus eritematoso sistémico (LES) es una patología autoinmune/inflamatoria que se caracteriza por la inflamación sistémica, presencia de autoanticuerpos y poblaciones de linfocitos autorreactivos. A pesar de los considerables esfuerzos y los recientes avances en la comprensión de la fisiopatología molecular del LES, el trastorno sigue siendo en gran medida desconocido.

Los eventos epigenéticos se han relacionado con la expresión la enfermedad en individuos genéticamente predispuestos al desarrollo de LES. Particularmente, la metilación e hidroximetilación alterada del ADN, así como las modificaciones histónicas, median cambios en la accesibilidad a la cromatina y la expresión génica en las células inmunitarias de pacientes con LES. Un control epigenético defectuoso contribuye a la expresión incontrolada de mediadores inflamatorios, incluyendo citoquinas y co-receptores, resultando en la inflamación sistémica y daño tisular. Aunque la implicación patofisiológica de los cambios epigenéticos en LES ha sido aceptada desde hace algún tiempo, sólo recientemente se ha  empezado a investigar y comprender los eventos moleculares que contribuyen a la desreegulación epigenética. 

Por lo tanto comprender las alteraciones epigenéticas con un enfoque en los eventos moleculares subyacentes puede ser objeto de medidas preventivas o estrategias de tratamiento a futuro.

Sin embargo, se necesitan estudios adicionales para rellenar los espacios en blanco y permitir la aplicación de patrones epigenéticos como biomarcadores de la enfermedad y/o dianas terapéuticas. Para lograr esto, se necesitan enfoques de colaboración cuidadosamente planificados para vincular los conjuntos de datos clínicos recogidos prospectivamente con los patrones genéticos y epigenéticos asociados, contribuyentes moleculares subyacentes y outcomes de la enfermedad.